本作是為了紀念在1996年起開始的《游戲王》系列漫畫連載二十周年所推出的動畫電影。在跨越無數的試練后，武藤游戲與身體內的另一人格“暗游戲”進行最終決戰并獲勝，在作出正式訣別后踏上各自的旅途。在經歷一段時間后，游戲等人重新回歸平凡的生活。然而，一名自稱藍神的神秘少年卻出現在他們的眼前。另一方面，將暗游戲視為勁敵的海馬瀨人，在暗游戲消失的地方發掘“千年積木”并打算將其重新完成，試圖再度復活暗游戲。
這種鳥其實大家都聽說過，就是平時你們見得比較少罷了。我們都學過一個成語：鷸蚌相爭，漁翁得利，這鳥就是那只倒。
嗯？秦川聲音不大，卻讓這個主席驚出了一身冷汗！
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